Bioinformática – Plataforma Agrobase https://plataforma.agrobase.com.br Sat, 12 Apr 2025 14:13:23 +0000 pt-BR hourly 1 https://wordpress.org/?v=5.3.18 https://plataforma.agrobase.com.br/wp-content/uploads/2019/12/cropped-android-chrome-512x512-1-32x32.png Bioinformática – Plataforma Agrobase https://plataforma.agrobase.com.br 32 32 Product design sr principal scientist [breeding] – PE, MG or MT https://plataforma.agrobase.com.br/vaga/product-design-sr-principal-scientist-breeding-pe-mg-or-mt Mon, 14 Apr 2025 03:16:09 +0000 https://plataforma.agrobase.com.br/?post_type=job_listing&p=1060993 ARE YOU READY FOR THE POSITION?
  • Spearhead leadership to architect the technical strategy to design improved cohorts of germplasm that are aligned with Product Concept targets from initial crossing through the handoff to Product Development;
  • Ensure alignment or resources, needs and usage with partners;
  • Cultivate and maintain collaborative relationships with Breeding R&D and Crop Science partner teams, including field testing, data science, engineering, molecular breeding, logistics, trait integration, Product Development, Market Development, and Commercial organizations to deliver a robust product pipeline;
  • Ensures meaningful knowledge and data transfer during transition points per crop cycle timelines;
  • Strategically unearth and catalyzes key areas of opportunity for new technology implementation and/or process improvement, while positively driving to a collaborative, innovative, and design-centric culture;
  • Initiates, integrates and leads projects/initiatives with partner teams and across world regions (NA, LATAM, EMEA, APAC), crops and technology to guide development and implementation of Precision Breeding;
  • Scout, mentor and elevate cross functional talent and serves as a coach and mentor for peers or colleagues in key areas of expertise that support personal development;
  • Champion the Health Safety & Environment, Compliance, Business Conduct and Human Rights policies and culture.

WHAT’S IN IT FOR YOU?

  • PhD degree in Genetics (human, animal or plant), Plant Breeding, Animal Breeding, Quantitative Genetics, Bioinformatics, Statistics, Data Science or other relevant scientific field with robust experience or MS degree with experience in breeding programs, genetics or applied data science projects;
  • Demonstrated experience working collaboratively in cross-functional and cross-cultural teams to achieve common goals;
  • Demonstrated experience leading and influencing activities of cross-functional teams without direct reporting relationships;
  • Ability to lead and influence key stakeholders through challenges and opportunities; facilitates solutions;
  • Results orientation with demonstrated ability to manage multiple projects/priorities simultaneously;
  • Experience in analysis of large biological data sets, quantitative genetics, biostatistics, and functional genomics;
  • Experience coding in R, Python or similar programming languages;
  • Strong collaboration ability demonstrated through building cross-functional partnerships and influencing others to drive results and solve business problems;
  • Demonstrated ability to manage complex problems;
  • Ability to communicate effectively in English and Portuguese;
  • Availability to work on-site as needed at any of our research locations: Sorriso – MT, Uberlândia – MG, or Petrolina – PE.
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Bolsista mestre para projeto com marcadores moleculares – Itapetininga/SP https://plataforma.agrobase.com.br/vaga/bolsista-mestre-para-projeto-com-marcadores-moleculares-itapetininga-sp Sat, 22 Mar 2025 03:20:41 +0000 https://plataforma.agrobase.com.br/?post_type=job_listing&p=1050037 Responsabilidades

Desenvolvimento de marcadores moleculares para Corymbia.

Requisitos

  • Pré-requisitos
    • Título: Mestre;
    • Formação: Agronomia, Biologia, Biotecnologia e correlatos.
  • Conhecimentos Necessários:
    • Experiência com Biologia Molecular;
    • Experiência com marcadores moleculares;
    • Conhecimento em bioinformática;
    • Idiomas: Inglês intermediário para leitura, escrita e conversação.
  • Conhecimentos Desejáveis:
    • Dissertação de mestrado com marcadores moleculares do tipo SNP.

Informações adicionais

  • Disponibilidade: 40h semanais;
  • Duração: 12 meses;
  • Bolsa Auxílio: R$ 5.600,00;
  • Atuação: Presencial;
  • Local: Itapetininga – SP.
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Pesquisador(a) em engenharia metabólica – Florianópolis/SC https://plataforma.agrobase.com.br/vaga/pesquisadora-em-engenharia-metabolica-florianopolis-sc Fri, 31 Jan 2025 03:06:41 +0000 https://plataforma.agrobase.com.br/?post_type=job_listing&p=1024144 Atividades
  • Desenvolver e aplicar modelos computacionais para otimizar rotas metabólicas em diferentes células e organismos, focando na melhoria de processos biotecnológicos.
  • Processar e analisar dados ômicos (genômica, transcriptômica, proteômica, metabolômica), interpretando os resultados para identificar alvos metabólicos e pontos de intervenção.
  • Integrar dados experimentais e modelos computacionais para prever e validar a eficiência das estratégias de otimização.
  • Colaborar com a equipe experimental na formulação e otimização de meios de cultura, utilizando modelos computacionais para direcionar a estratégia.
  • Identificar biomarcadores para monitoramento do comportamento de culturas celulares e organismos.
  • Integrar dados experimentais com modelos computacionais, facilitando a previsão de resultados e a melhoria contínua de processos. Elaborar POPs e assegurar que os procedimentos atendam às normas e regulamentações aplicáveis.
  • Participar de workshops internos para compartilhar avanços, discutir desafios e promover a troca de conhecimentos entre as equipes.

Requisitos

  • Proficiência em linguagens de programação como Python e R, com experiência em desenvolvimento de scripts e pipelines de análise de dados biológicos.
  • Domínio de ferramentas de modelagem metabólica, como COBRA Toolbox, FBA (Flux Balance Analysis), MFA (Metabolic Flux Analysis), Genome-scale Metabolic Models e outras abordagens computacionais relevantes à área.
  • Habilidade em trabalhar com big data e bancos de dados biológicos (Ensembl, KEGG, NCBI, Uniprot). Desejável experiência com consumo de APIs REST.
  • Experiência no uso de modelos computacionais para identificar alvos para edição genética (CRISPR/Cas9 e outros), visando otimização de rotas metabólicas.
  • Auxiliar na gestão de dados biológicos no banco de dados do centro de pesquisa. Garantir a atualização, segurança e acessibilidade dos dados, além de colaborar na implementação de ferramentas computacionais para otimização do banco.
  • Conhecimento em sistemas de versionamento de código (e.g. Git) e de arquiteturas em nuvem é um diferencial.
  • Desejável experiência com técnicas analíticas (HPLC, GC, espectrometria de massa) para monitoramento de metabolitos e avaliação de desempenho das rotas metabólicas.
  • Formação em Ciências Computacionais, Biotecnologia, Engenharia Bioquímica, Ciências Biológicas, ou áreas correlatas. Pós-graduação em Bioinformática, Eng. Bioquímica, Eng. Metabólica, Eng. Genômica, ou áreas correlatas.
  • Experiência prévia em modelagem metabólica e bioinformática, com conhecimento prático em células e/ou organismos.
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Pesquisador(a) em bioinformática – Florianópolis/SC https://plataforma.agrobase.com.br/vaga/pesquisadora-em-bioinformatica-florianopolis-sc Fri, 31 Jan 2025 03:06:24 +0000 https://plataforma.agrobase.com.br/?post_type=job_listing&p=1024139 Atividades
  • Aplicar conceitos de biologia de sistemas para analisar e modelar redes biológicas complexas, com foco em interações entre genes, proteínas e metabolitos.
  • Realizar análise integrativa e de enriquecimento de dados ômicos para entender a regulação e dinâmica biológica em células e organismos de interesse.
  • Desenvolver e aplicar modelos computacionais para descrever processos biológicos eficientes a partir da otimização do metabolismo, regulação gênica e interações célula-ambiente e organismo-ambiente.
  • Utilizar ferramentas de bioinformática para analisar dados de sequenciamento, anotação de genomas, identificação de biomarcadores e análise de variantes genéticas em diferentes espécies.
  • Integrar dados experimentais com modelos de redes metabólicas e de regulação gênica, com o intuito de prever comportamentos biológicos e orientar a otimização de cultivos.
  • Criar e manter pipelines de análise de dados ômicos, garantindo automação, reprodutibilidade e eficiência nos processos de análise.
  • Integrar dados experimentais com modelos computacionais, facilitando a previsão de resultados e a melhoria contínua de processos. Elaborar POPs e assegurar que os procedimentos atendam às normas e regulamentações aplicáveis.
  • Colaborar com equipes interdisciplinares para gerar insights que possam orientar a otimização de projetos estratégicos.

Requisitos

  • Proficiência em linguagens de programação como Python e R, com experiência em desenvolvimento de scripts e pipelines de análise de dados biológicos.
  • Conhecimento de ferramentas de análise genômica (BLAST, HISAT2, Trinity, OrthoFinder).
  • Habilidade em trabalhar com big data e bancos de dados biológicos (Ensembl, KEGG, NCBI, Uniprot). Desejável experiência com consumo de APIs REST.
  • Auxiliar na gestão de dados de bioinformática no banco de dados do centro de pesquisa. Garantir a atualização, segurança e acessibilidade dos dados, além de colaborar na implementação de ferramentas computacionais para otimização do banco.
  • Conhecimento em sistemas de versionamento de código (e.g. Git) e de arquiteturas em nuvem é um diferencial.
  • Formação em Ciências Computacionais, Biotecnologia, Engenharia Bioquímica, Ciências Biológicas, ou áreas correlatas. Pós-graduação em Bioinformática, Eng. Bioquímica, Eng. Metabólica, Eng. Genômica, ou áreas correlatas.
  • Experiência prévia em modelagem metabólica e bioinformática, com conhecimento prático em células e/ou organismos.
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Coordenador(a) de pré-analítico – São Paulo/SP https://plataforma.agrobase.com.br/vaga/coordenadora-de-pre-analitico-sao-paulo-sp Fri, 10 Jan 2025 03:04:32 +0000 https://plataforma.agrobase.com.br/?post_type=job_listing&p=1011302 Responsabilidades e atribuições
  • Desenvolver, coordenar e disseminar as estratégias gerenciais e operacionais do pré-analítico;
  • Estabelecer networking com as áreas estratégicas da companhia e garantir um ambiente seguro e propicio à inovação a fim de garantir o cumprimento dos padrões de eficiência, qualidade e segurança no preparo do paciente;
  • coleta, acondicionamento e transporte do material biológico, com foco na entrega da melhor experiência ao paciente.

Requisitos e qualificações

  • Experiência na área de pré analítico, coleta;
  • Superior completo: Medicina, Biomedicina, Farmácia-Bioquímica, Biologia, Enfermagem;
  • inglês intermediário.
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Bioinformata – São Paulo/SP https://plataforma.agrobase.com.br/vaga/bioinformata-sao-paulo-sp Sat, 14 Dec 2024 03:04:50 +0000 https://plataforma.agrobase.com.br/?post_type=job_listing&p=1003479 Responsabilidades e atribuições
  • Liderar a execução de softwares e pipelines para o processamento de grandes volumes de dados em bioinformática;
  • Monitorar logs e métricas geradas durante o processamento, garantindo a qualidade dos resultados e a segurança dos pacientes;
  • Realizar a manutenção avançada dos sistemas de bioinformática, identificando e solucionando problemas críticos;
  • Implementar estratégias de backup de dados para assegurar a integridade e disponibilidade das informações;
  • Colaborar ativamente com as equipes de TI e outros departamentos para otimizar processos de integração e interface na rotina diagnóstica;
  • Propor e implementar melhorias contínuas para otimizar os processos e aumentar a eficiência.

Requisitos e qualificações

  • Ensino superior completo em áreas como Informática Biomédica, Bioinformática, Ciência da Computação, Biologia Molecular, Matemática, Biologia, Biomedicina, Farmácia/Bioquímica, Ciências Moleculares, Medicina, Engenharia, Estatística ou áreas correlatas;
  • Pós-graduação em Bioinformática (mestrado e/ou doutorado) em andamento ou concluída, ou experiência profissional comprovada na área;
  • Inglês avançado;
  • Experiência comprovada em manipulação e análise de dados de plataformas de NGS;
  • Proficiência em linguagens de programação Python e habilidades em scripts BASH;
  • Experiência com consumo de APIs REST;
  • Conhecimento avançado de desenvolvimento web;
  • Conhecimento com sistemas de versionamento de código, como Git;
  • Experiência em análises estatísticas;
  • Experiência em ambientes de computação em nuvem (AWS, GCP, Azure, etc.).
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Bolsa na área de bioinformática (foco em i.a.) – Rio de Janeiro/RJ https://plataforma.agrobase.com.br/vaga/bolsa-na-area-de-bioinformatica-foco-em-i-a-rio-de-janeiro-rj Fri, 13 Dec 2024 03:05:47 +0000 https://plataforma.agrobase.com.br/?post_type=job_listing&p=1003088 Requisitos
  • Doutorado concluído em Biologia, Biociências, Bioinformática, Biomedicina, Ciências da Computação ou áreas afins.
  • Experiência em linguagens de programação e no uso de dados biológicos em larga escala.
  • Experiência em abordagens de Inteligência Artificial.
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Bolsa em laboratório de bioinformática – Petrópolis/RJ https://plataforma.agrobase.com.br/vaga/bolsa-em-laboratorio-de-bioinformatica-petropolis-rj Sat, 23 Nov 2024 03:05:04 +0000 https://plataforma.agrobase.com.br/?post_type=job_listing&p=995055 Requisitos
  • O candidato deverá ter doutorado completo nas áreas de ciências da vida ou exatas, isto é, Biologia, Bioinformática, Ciências Biomédicas, Ciências da Computação, Modelagem Computacional ou áreas afins;
  • É necessário conhecimento e experiência no uso de linguagem de programação Python, R, ou outras linguagens;
  • Uso do sistema operacional Linux/Unix;
  • Conhecimento no uso de banco de dados biológicos;
  • Experiência no uso e desenvolvimento de ferramentas computacionais para análises e integração de dados “ ômicos”;
  • Experiência na construção e/ou manutenção de workflows de análises bioinformáticas;
  • Conhecimento prático de métodos estatísticos e técnicas de inteligência artificial aplicadas à resolução de problemas em bioinformática;
  • Capacidade de trabalhar em equipe, com boas habilidades de comunicação e colaboração;
  • Inglês intermediário ou avançado, necessário para leitura de artigos científicos.

Documentos necessários

  • CV lattes atualizado
  • Carta de motivação

O processo seletivo será realizado em duas etapas

  • Análise da documentação
  • Entrevista (somente para os selecionados na 1ª. Etapa)
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Pesquisador jr (bioinformática) – Florianópolis/SC https://plataforma.agrobase.com.br/vaga/pesquisador-jr-bioinformatica-florianopolis-sc Mon, 11 Nov 2024 03:04:19 +0000 https://plataforma.agrobase.com.br/?post_type=job_listing&p=989579 Atividades
  • As atividades do Pesquisador de Bioinformática têm como foco a participação em projetos de pesquisa, desenvolvimento e inovação voltados para a indústria.
  • Essas atividades incluem o desenvolvimento de pipelines para análise de dados multiômicos (genômica, transcriptômica, proteômica e metabolômica), a criação e otimização de algoritmos para análise de grandes volumes de dados biológicos, processamento e integração de diferentes tipos de dados ômicos, e o uso de ferramentas de machine learning e inteligência artificial para a identificação de padrões.
  • Além disso, envolve a análise e interpretação de dados de sequenciamento de nova geração (NGS) e o desenvolvimento de workflows automatizados para a análise de genomas, metagenomas e outros dados ômicos.
  • Também é esperada a participação na prospecção de novos projetos, levantamento de requisitos junto a clientes, e escrita de documentação científica e técnica, além da colaboração e/ou gerenciamento de equipes multidisciplinares para a aplicação dos resultados em ambientes operacionais e industriais.

Requisitos

  • 06 meses de experiência em análise de dados de Bioinformática, desenvolvimento de pipelines e automação de fluxo de dados biológicos, voltados para projetos de P&D em projetos de inovação para a Indústria;
  • Superior completo em Ciências da Computação, Bioinformática, Genética, Biologia, Biotecnologia ou áreas correlatas;
  • CNH B Válida;
  • Disponibilidade de viagens e deslocamentos;
  • Com atuação remota a combinar.

Infos adicionais

  • Salário: R$7885,86;
  • Carga horária: 200 horas/mês;
  • Horário de trabalho: Segunda à sexta -feira das 08:00 às 12:00 e das 13:00 às 17:00.
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Vaga para mestrado (projeto de bioinformática) – PR https://plataforma.agrobase.com.br/vaga/vaga-para-mestrado-projeto-de-bioinformatica-pr Fri, 18 Oct 2024 03:05:31 +0000 https://plataforma.agrobase.com.br/?post_type=job_listing&p=979251 As principais atividades do trabalho experimental
  • Desenvolvimento de projeto em bioinformática 0 na análise de dados de sequenciamento de 0 genomas completos do ser humano.

Requisitos

  • Graduação em Biologia, Biomedicina, Biotecnologia ou áreas afins;
  • CR≥ 7,0

Outras Informações

  •  Enviar CV Lattes em PDF
  • Anexar carta de motivação
  • Início em fevereiro de 2025
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