Desenvolvimento de marcadores moleculares para Corymbia.

Requisitos

• Pré-requisitos
  • Título: Mestre;
  • Formação: Agronomia, Biologia, Biotecnologia e correlatos.
• Conhecimentos Necessários:
  • Experiência com Biologia Molecular;
  • Experiência com marcadores moleculares;
  • Conhecimento em bioinformática;
  • Idiomas: Inglês intermediário para leitura, escrita e conversação.
• Conhecimentos Desejáveis:
  • Dissertação de mestrado com marcadores moleculares do tipo SNP.

Informações adicionais

• Disponibilidade: 40h semanais;
• Duração: 12 meses;
• Bolsa Auxílio: R$ 5.600,00;
• Atuação: Presencial;
• Local: Itapetininga – SP.

• Desenvolver e aplicar modelos computacionais para otimizar rotas metabólicas em diferentes células e organismos, focando na melhoria de processos biotecnológicos.
• Processar e analisar dados ômicos (genômica, transcriptômica, proteômica, metabolômica), interpretando os resultados para identificar alvos metabólicos e pontos de intervenção.
• Integrar dados experimentais e modelos computacionais para prever e validar a eficiência das estratégias de otimização.
• Colaborar com a equipe experimental na formulação e otimização de meios de cultura, utilizando modelos computacionais para direcionar a estratégia.
• Identificar biomarcadores para monitoramento do comportamento de culturas celulares e organismos.
• Integrar dados experimentais com modelos computacionais, facilitando a previsão de resultados e a melhoria contínua de processos. Elaborar POPs e assegurar que os procedimentos atendam às normas e regulamentações aplicáveis.
• Participar de workshops internos para compartilhar avanços, discutir desafios e promover a troca de conhecimentos entre as equipes.

Requisitos

• Proficiência em linguagens de programação como Python e R, com experiência em desenvolvimento de scripts e pipelines de análise de dados biológicos.
• Domínio de ferramentas de modelagem metabólica, como COBRA Toolbox, FBA (Flux Balance Analysis), MFA (Metabolic Flux Analysis), Genome-scale Metabolic Models e outras abordagens computacionais relevantes à área.
• Habilidade em trabalhar com big data e bancos de dados biológicos (Ensembl, KEGG, NCBI, Uniprot). Desejável experiência com consumo de APIs REST.
• Experiência no uso de modelos computacionais para identificar alvos para edição genética (CRISPR/Cas9 e outros), visando otimização de rotas metabólicas.
• Auxiliar na gestão de dados biológicos no banco de dados do centro de pesquisa. Garantir a atualização, segurança e acessibilidade dos dados, além de colaborar na implementação de ferramentas computacionais para otimização do banco.
• Conhecimento em sistemas de versionamento de código (e.g. Git) e de arquiteturas em nuvem é um diferencial.
• Desejável experiência com técnicas analíticas (HPLC, GC, espectrometria de massa) para monitoramento de metabolitos e avaliação de desempenho das rotas metabólicas.
• Formação em Ciências Computacionais, Biotecnologia, Engenharia Bioquímica, Ciências Biológicas, ou áreas correlatas. Pós-graduação em Bioinformática, Eng. Bioquímica, Eng. Metabólica, Eng. Genômica, ou áreas correlatas.
• Experiência prévia em modelagem metabólica e bioinformática, com conhecimento prático em células e/ou organismos.

• Aplicar conceitos de biologia de sistemas para analisar e modelar redes biológicas complexas, com foco em interações entre genes, proteínas e metabolitos.
• Realizar análise integrativa e de enriquecimento de dados ômicos para entender a regulação e dinâmica biológica em células e organismos de interesse.
• Desenvolver e aplicar modelos computacionais para descrever processos biológicos eficientes a partir da otimização do metabolismo, regulação gênica e interações célula-ambiente e organismo-ambiente.
• Utilizar ferramentas de bioinformática para analisar dados de sequenciamento, anotação de genomas, identificação de biomarcadores e análise de variantes genéticas em diferentes espécies.
• Integrar dados experimentais com modelos de redes metabólicas e de regulação gênica, com o intuito de prever comportamentos biológicos e orientar a otimização de cultivos.
• Criar e manter pipelines de análise de dados ômicos, garantindo automação, reprodutibilidade e eficiência nos processos de análise.
• Integrar dados experimentais com modelos computacionais, facilitando a previsão de resultados e a melhoria contínua de processos. Elaborar POPs e assegurar que os procedimentos atendam às normas e regulamentações aplicáveis.
• Colaborar com equipes interdisciplinares para gerar insights que possam orientar a otimização de projetos estratégicos.

Requisitos

• Proficiência em linguagens de programação como Python e R, com experiência em desenvolvimento de scripts e pipelines de análise de dados biológicos.
• Conhecimento de ferramentas de análise genômica (BLAST, HISAT2, Trinity, OrthoFinder).
• Habilidade em trabalhar com big data e bancos de dados biológicos (Ensembl, KEGG, NCBI, Uniprot). Desejável experiência com consumo de APIs REST.
• Auxiliar na gestão de dados de bioinformática no banco de dados do centro de pesquisa. Garantir a atualização, segurança e acessibilidade dos dados, além de colaborar na implementação de ferramentas computacionais para otimização do banco.
• Conhecimento em sistemas de versionamento de código (e.g. Git) e de arquiteturas em nuvem é um diferencial.
• Formação em Ciências Computacionais, Biotecnologia, Engenharia Bioquímica, Ciências Biológicas, ou áreas correlatas. Pós-graduação em Bioinformática, Eng. Bioquímica, Eng. Metabólica, Eng. Genômica, ou áreas correlatas.
• Experiência prévia em modelagem metabólica e bioinformática, com conhecimento prático em células e/ou organismos.

• Desenvolver, coordenar e disseminar as estratégias gerenciais e operacionais do pré-analítico;
• Estabelecer networking com as áreas estratégicas da companhia e garantir um ambiente seguro e propicio à inovação a fim de garantir o cumprimento dos padrões de eficiência, qualidade e segurança no preparo do paciente;
• coleta, acondicionamento e transporte do material biológico, com foco na entrega da melhor experiência ao paciente.

Requisitos e qualificações

• Experiência na área de pré analítico, coleta;
• Superior completo: Medicina, Biomedicina, Farmácia-Bioquímica, Biologia, Enfermagem;
• inglês intermediário.

• Liderar a execução de softwares e pipelines para o processamento de grandes volumes de dados em bioinformática;
• Monitorar logs e métricas geradas durante o processamento, garantindo a qualidade dos resultados e a segurança dos pacientes;
• Realizar a manutenção avançada dos sistemas de bioinformática, identificando e solucionando problemas críticos;
• Implementar estratégias de backup de dados para assegurar a integridade e disponibilidade das informações;
• Colaborar ativamente com as equipes de TI e outros departamentos para otimizar processos de integração e interface na rotina diagnóstica;
• Propor e implementar melhorias contínuas para otimizar os processos e aumentar a eficiência.

Requisitos e qualificações

• Ensino superior completo em áreas como Informática Biomédica, Bioinformática, Ciência da Computação, Biologia Molecular, Matemática, Biologia, Biomedicina, Farmácia/Bioquímica, Ciências Moleculares, Medicina, Engenharia, Estatística ou áreas correlatas;
• Pós-graduação em Bioinformática (mestrado e/ou doutorado) em andamento ou concluída, ou experiência profissional comprovada na área;
• Inglês avançado;
• Experiência comprovada em manipulação e análise de dados de plataformas de NGS;
• Proficiência em linguagens de programação Python e habilidades em scripts BASH;
• Experiência com consumo de APIs REST;
• Conhecimento avançado de desenvolvimento web;
• Conhecimento com sistemas de versionamento de código, como Git;
• Experiência em análises estatísticas;
• Experiência em ambientes de computação em nuvem (AWS, GCP, Azure, etc.).

• Doutorado concluído em Biologia, Biociências, Bioinformática, Biomedicina, Ciências da Computação ou áreas afins.
• Experiência em linguagens de programação e no uso de dados biológicos em larga escala.
• Experiência em abordagens de Inteligência Artificial.

• O candidato deverá ter doutorado completo nas áreas de ciências da vida ou exatas, isto é, Biologia, Bioinformática, Ciências Biomédicas, Ciências da Computação, Modelagem Computacional ou áreas afins;
• É necessário conhecimento e experiência no uso de linguagem de programação Python, R, ou outras linguagens;
• Uso do sistema operacional Linux/Unix;
• Conhecimento no uso de banco de dados biológicos;
• Experiência no uso e desenvolvimento de ferramentas computacionais para análises e integração de dados “ ômicos”;
• Experiência na construção e/ou manutenção de workflows de análises bioinformáticas;
• Conhecimento prático de métodos estatísticos e técnicas de inteligência artificial aplicadas à resolução de problemas em bioinformática;
• Capacidade de trabalhar em equipe, com boas habilidades de comunicação e colaboração;
• Inglês intermediário ou avançado, necessário para leitura de artigos científicos.

Documentos necessários

• CV lattes atualizado
• Carta de motivação

O processo seletivo será realizado em duas etapas

• Análise da documentação
• Entrevista (somente para os selecionados na 1ª. Etapa)

• As atividades do Pesquisador de Bioinformática têm como foco a participação em projetos de pesquisa, desenvolvimento e inovação voltados para a indústria.
• Essas atividades incluem o desenvolvimento de pipelines para análise de dados multiômicos (genômica, transcriptômica, proteômica e metabolômica), a criação e otimização de algoritmos para análise de grandes volumes de dados biológicos, processamento e integração de diferentes tipos de dados ômicos, e o uso de ferramentas de machine learning e inteligência artificial para a identificação de padrões.
• Além disso, envolve a análise e interpretação de dados de sequenciamento de nova geração (NGS) e o desenvolvimento de workflows automatizados para a análise de genomas, metagenomas e outros dados ômicos.
• Também é esperada a participação na prospecção de novos projetos, levantamento de requisitos junto a clientes, e escrita de documentação científica e técnica, além da colaboração e/ou gerenciamento de equipes multidisciplinares para a aplicação dos resultados em ambientes operacionais e industriais.

Requisitos

• 06 meses de experiência em análise de dados de Bioinformática, desenvolvimento de pipelines e automação de fluxo de dados biológicos, voltados para projetos de P&D em projetos de inovação para a Indústria;
• Superior completo em Ciências da Computação, Bioinformática, Genética, Biologia, Biotecnologia ou áreas correlatas;
• CNH B Válida;
• Disponibilidade de viagens e deslocamentos;
• Com atuação remota a combinar.

Infos adicionais

• Salário: R$7885,86;
• Carga horária: 200 horas/mês;
• Horário de trabalho: Segunda à sexta -feira das 08:00 às 12:00 e das 13:00 às 17:00.

• Desenvolvimento de projeto em bioinformática 0 na análise de dados de sequenciamento de 0 genomas completos do ser humano.

Requisitos

• Graduação em Biologia, Biomedicina, Biotecnologia ou áreas afins;
• CR≥ 7,0

Outras Informações

•  Enviar CV Lattes em PDF
• Anexar carta de motivação
• Início em fevereiro de 2025

• Desenvolver e gerir os projetos/produtos, combinando conceitos bioquímicos e de química analítica com computação, incorporando aspectos de qualidade técnico-médica e segurança do paciente.
• Auxiliar na implementação e na manutenção de pipelines e algoritmos para processamento em bioinformática (proteômica e sistemas baseados em cromatografia e espectrometria de massas).
• Desenvolver, programar e integrar os robôs pipetadores para aplicações em diversas matrizes biológicas.
• Analisar fluxos de trabalho, quantificar possíveis melhorias e desenvolver soluções interativas para aumentar a performance operacional do setor.
• Atuar como suporte e planejamento de arquitetura e infraestrutura para aquisição de dados bioanalíticos.
• Responder pela manutenção de sistema em rotina que envolve conexão com servidores remotos e interfaceamento de equipamentos com sistema de informática laboratorial.
• Analisar dados biológicos para geração de insights clínicos.
• Auxiliar os analistas no processamento de dados de proteômica.
• Treinar os colaboradores em softwares de Bioinformática (proteômica).
• Zelar pela qualidade objetivando segurança de processo e do paciente.

Requisitos

• Superior completo em Bioinformática, Biotecnologia, Informática Biomédica, Engenharia Biomédica, Ciências Biológicas, Ciências Biomédicas, Farmácia-Bioquímica ou Ciências da Computação. Em caso de formação em Ciências Biológicas e Ciências da Computação é obrigatória a experiência e/ou especialização em Bioinformática.
• Linguagens: Python, R ou similares.
• Sistemas operacionais Windows e Linux, incluindo operações por linha de comando.
• Noções de manutenção de banco de dados relacionais e não relacionais.
• Infraestrutura de processamento e armazenamento de dados, incluindo Cloud (AWS).
• Conhecimentos teóricos em técnicas cromatográficas e proteômica.
• Inglês intermediário para leitura e escrita.

Desejável

• Pós-Graduação completa na área de Bioinformática ou Informática Biomédica.
• Conhecimento em programação de pipetadores automatizados (ex: Hamilton).
• Softwares de processamento de dados cromatográficos (MassLynx, Empower, Xcalibur, MassHunter, Chromeleon, TraceFinder).
• Softwares de processamento em proteômica (Maxquant, TPP, Scaffold).
• XCMS e softwares de integração de dados multiômicos.