• Cumprir as atividades e carga horária previstas.
• Apresentar um Plano de Trabalho com as atividades e entregas planejadas, aderentes ao Projeto associado à vaga, junto ao Supervisor.
• Entregar à Gestão de Projetos do ITV DS o relatório de atividades final da bolsa, devidamente aprovado pela Coordenação da Bolsa e aderente ao Plano de Trabalho aprovado.

Requisitos

• QUALIFICAÇÕES MÍNIMAS
  • Estar regularmente matriculado(a) em programa de pós-graduação stricto sensu.
  • Ter concluído a graduação.
  • O desenvolvimento do projeto de pesquisa resultará na dissertação do(a) bolsista.
• QUALIFICAÇÕES PREFERENCIAIS
  • Ter potencial e aderência na área de pesquisa ao qual está pleiteando a bolsa.

Áreas de Pesquisa

Biodiversidade e Soluções Ambientais, Genômica Ambiental, Inteligência Ambiental e Territórios e Recursos Naturais.

• Desenvolvimento e aplicação de métodos de aprendizado de máquina e ia explicável (xai) para identificação de padrões mutacionais.
• Integração de dados multimodais e multi-ômicos.
• Análise de dados de bases públicas (incluindo tcga/gdc, ucsc e icgc).
• Desenvolvimento de pipelines computacionais reprodutíveis para análise de dados genômicos.
• Apoio à produção científica e colaboração internacional.
• Contribuir para boas práticas de versionamento de código, documentação e reprodutibilidade científica.

Requisitos

• Requisitos
  • Formação em computação, estatística e correlatas ou biológicas com ênfase computacional.
  • Conhecimento em python e/ou.
  • Experiência em ambiente linux/unix.
  • Familiaridade com sistemas de versionamento (git).
  • Experiência com jupyter notebook e/ou google colab.
• Qualificações desejáveis
  • Experiência com dados multi-ômicos e aprendizado de máquina.
  • Familiaridade com bioconductor e bioconda.
  • Bibliotecas scikit-learn, tensorflow, pytorch.

• Atuar no desenvolvimento, validação e inovação de testes diagnósticos de alta complexidade, garantindo excelência técnica, qualidade científica e atualização constante em Genômica e Biologia Molecular, além de contribuir com projetos de pesquisa, inovação e capacitação técnica da equipe.
• Desenvolvimento e validação de testes diagnósticos de alta complexidade, com foco em Genômica e Biologia Molecular.
• Verificação e validação de novos materiais, insumos e equipamentos.
• Implementação de melhorias contínuas em metodologias e processos laboratoriais.
• Planejamento, escrita, execução e acompanhamento de projetos científicos.
• Elaboração, revisão e execução de protocolos, incluindo checklist de necessidades técnicas.
• Garantir a qualidade técnica na execução, interpretação, análise e liberação de resultados.
• Definição de estratégias amostrais para processos de validação.
• Atuação em troubleshootings técnicos e científicos.
• Elaboração e revisão de documentos de validação (Relatórios, POD, REQ, Ficha Técnica).
• Treinamento técnico e capacitação da equipe operacional para novos protocolos e metodologias.
• Suporte técnico e científico à equipe, orientando sobre equipamentos, metodologias e interpretação de resultados.
• Atuação ativa na busca por inovação, novas tecnologias e metodologias.
• Produção e participação em publicações científicas.
• Eventual participação em palestras, aulas e apresentações sobre Genômica e Biologia Molecular para diferentes públicos.

Requisitos

• Experiência em análise de dados de NGS.
• Vivência com testes relacionados à reprodução humana.
• Experiência com múltiplas metodologias de Biologia Molecular.

Benefícios

• Cuidados com a alimentação: Vale Refeição/Vale Alimentação ou Refeitório no local de trabalho.
• Cuidados com a saúde: Plano de Saúde e Seguro de Vida.
• Cuidados com o seu desenvolvimento: Universidade da empresa, Ciclo de Desenvolvimento e Carreira, Academias de Tecnologia/PMAX e Programa Crescer dentro da empresa.
• Outros: Vale Transporte e Bonificação por desempenho (PPR).
• Programa de Saúde, pautado em 5 pilares: Espiritual: yoga.
• Físico: TotalPass, clínica de atenção primária, descontos em exames e vacinas.
• Intelectual: Universidade da empresa.
• Relacional: Clube de vantagens UAU e benefícios SESC.
• Emocional: Telepsicologia.

• Executar os procedimentos operacionais para realização de exames laboratoriais de biologia molecular, preparando amostras, reagentes e armazenando soluções para garantir o registro, a prevenção de contaminações e a rastreabilidade dos processos.
• Realizar procedimentos de higienização e conservação de materiais, equipamentos, vasilhames, bancadas, dentre outros que se façam necessários ao exercício da função, conforme protocolos pré-estabelecidos.
• Receber e inspecionar amostras biológicas com o objetivo de processá-las no setor técnico, zelando pela qualidade de representação de acordo com critérios estabelecidos nos protocolos e pelo cumprimento dos padrões de aceitação previstos nos documentos da qualidade.
• Realizar a verificação de equipamentos e de controle de temperatura, visando garantir a segurança e prevenção de eventuais danos que possam prejudicar o processo e andamento dos exames.
• Controlar a utilização do estoque do setor e repassar as informações ao responsável pela requisição e compra dos insumos, de forma a assegurar o estoque mínimo de utilização.
• Descartar resíduos químicos e biológicos seguindo o regulamento específico, conforme normas de biossegurança e de meio ambiente.
• Controlar o arquivamento de soroteca e documentação do paciente conforme procedimentos padrões do setor, visando garantir a rastreabilidade e o controle de qualidade.
• Realizar a análise, conferência e liberação de laudos.
• Realizar registros de incidentes para o processo de qualidade.
• Entre outras atividades relacionadas ao cargo.

Requisitos

• Ensino superior completo em Biomedicina, Biologia, Farmácia ou áreas correlatas.
• Experiência em técnicas de biologia molecular como extração de DNA e RNA, PCR, PCR em tempo real, sequenciamento Sanger e principalmente NGS.

Benefícios

• Assistência médica.
• Assistência odontológica.
• Auxílio academia.
• Seguro de vida.
• Vale-alimentação.
• Vale-refeição.
• Vale-transporte.

• Emitir comentários, interpretações, conclusões e orientações com base na análise de dados.
• Confeccionar relatórios na língua inglesa e portuguesa.
• Analisar dados biológicos complexos, como DNA/RNA (NGS, Sanger, entre outros).
• Processar grandes volumes de dados genômicos/metagênomicos/transcriptômicos.
• Usar ferramentas e linguagens de forma eficaz, como Qiime, Python, R, entre outros.
• Trabalhar com banco de dados biológicos como NCBI, EMBL e Ensembl.
• Interpretar variantes genéticas, mutações, filogenias, classificações.
• Atualizar classificações, nomenclaturas e outras informações de forma constante.
• Desenvolver fluxos automatizados de etapas (pipelines).
• Garantir reprodutibilidade de resultados.
• Manter eficiência nas automações.
• Trabalhar com grande escala de dados de forma organizada e rastreável em revisões e auditorias.
• Confeccionar relatórios simples e complexos.
• Revisar relatórios confeccionados.
• Prezar pelos padrões estabelecidos dos relatórios e manter a atualização constante destes.
• Participar de forma ativa na melhoria de processos, ensaios e análises.
• Construir, manter e promover bancos de dados.
• Ajudar a coordenação na organização de dados de amostras.

Benefícios

• Assistência médica.
• Assistência odontológica.
• Horário flexível.
• Vale alimentação.
• Vale combustível.
• Vale cultura.
• Plano de carreira.
• Vale transporte.
• Vale refeição.
• Plano de Saúde.
• VR / VA.
• Vale mobilidade.
• VT.
• Vale flexível: educação, cultura e lazer.
• DentalUni.

• Projetar pipelines reprodutíveis (pré-processamento, alinhamento, chamadas de variantes, gVCF, joint-calling) utilizando containers e seguindo melhores práticas internacionais (GATK Best Practices, nf-core).
• Estabelecer métricas de qualidade para sequências (FASTQ/BAM/VCF) e metadados clínico-fenotípicos, definindo thresholds, alertas e relatórios.
• Desenvolver rotinas automatizadas para ingestão, auditoria e curadoria, garantindo eficiência, padronização e rastreabilidade.
• Apoiar a construção de catálogos agregados de variantes (frequências populacionais), indexação e versionamento de metadados conforme ontologias reconhecidas (HPO, SNOMED-CT, OMOP, GA4GH).
• Elaborar documentos técnicos, guias e templates para garantir governança, auditoria e reprodutibilidade dos processos.
• Atuar na articulação com equipes de centros de pesquisa, laboratórios de sequenciamento e projetos financiados pelo DECIT que geram dados genômicos.
• Participar de reuniões técnicas nacionais e internacionais, produzindo apresentações, relatórios de progresso e materiais técnicos de comunicação.
• Criar e manter documentação completa e clara, garantindo que pipelines e procedimentos possam ser mantidos, auditados e evoluídos pela equipe no futuro.

Requisitos

• QUALIFICAÇÕES MÍNIMAS
  • Mestrado em Bioinformática ou áreas correlatas envolvendo ciências da saúde, biologia computacional, genética, ciência de dados biomédicos ou informática aplicada à genômica humana.
  • Mínimo de 5 anos em bioinformática (acadêmica ou profissional), com atuação comprovada em genômica.
  • Experiência sólida no desenho, implementação, operação e otimização de pipelines reprodutíveis (pré-processamento, mapeamento, chamadas de variantes, joint-genotyping etc.).
  • Participação prévia como bioinformata em projetos de genômica.
  • Experiência prática com Nextflow e/ou WDL/Cromwell, incluindo execução em ambientes HPC.
  • Domínio de ferramentas essenciais: GATK, BWA, samtools/bcftools, Picard.
  • Uso de ontologias biomédicas (HPO, SNOMED, OMOP) ou experiência em mapeamento de metadados clínicos.
  • Experiência com containers (Docker, Singularity/Apptainer).
  • Vivência em QC e curadoria de dados genômicos.
  • Conhecimento de ambientes HPC (SLURM, filas, quotas, logs, storage distribuído).
  • Sólida experiência em Linux e Shell Script.
  • Experiência com Git, versionamento, CI/CD e boas práticas de engenharia de software.
  • Comunicação clara, inclusive para traduzir conceitos complexos a equipes multidisciplinares.
  • Capacidade de liderança técnica e mentoria de bioinformatas mais jovens.
  • Abordagem analítica e orientada à solução de problemas.
  • Capacidade de trabalhar em ambiente colaborativo e de alta responsabilidade científica.
• QUALIFICAÇÕES PREFERENCIAIS
  • Experiência com padrões GA4GH (htsget, refget, DUO, Phenopackets).
  • Experiência no uso de ferramentas e estrutura de dados para registro de dados fenotípicos como RedCAP.
  • Familiaridade com modelos de dados clínicos, especialmente OMOP-CDM.
  • Inglês intermediário, especialmente para reuniões e apresentações.
  • Doutorado em Bioinformática ou áreas correlatas.
  • Publicações científicas relevantes em genômica ou bioinformática.
  • Experiência prévia em projetos nacionais ou multicêntricos de grande escala.
  • Experiência com pipelines nf-core, HAIL ou Spark genômico.
  • Conhecimento de processamento em GPU e Nvidia Parabricks em genômica.

Benefícios

• Ambiente acolhedor e colaborativo.
• Profissionais altamente qualificados e multidisciplinares.
• Infraestrutura de ponta (HPC, data lake seguro, TRE).
• Incentivo à inovação, formação contínua e autonomia científica.

• Desenho e implementação de pipelines de bioinformática: Projetar pipelines reprodutíveis (pré-processamento, alinhamento, chamadas de variantes, gVCF, joint-calling) utilizando containers e seguindo melhores práticas internacionais (GATK Best Practices, nf-core).
• Definir painéis/métricas de QC: Estabelecer métricas de qualidade para sequências (FASTQ/BAM/VCF) e metadados clínico-fenotípicos, definindo thresholds, alertas e relatórios.
• Automatização: Desenvolver rotinas automatizadas para ingestão, auditoria e curadoria, garantindo eficiência, padronização e rastreabilidade.
• Consolidar catálogos e metadados: Apoiar a construção de catálogos agregados de variantes (frequências populacionais), indexação e versionamento de metadados conforme ontologias reconhecidas (HPO, SNOMED-CT, OMOP, GA4GH).
• Procedimentos Operacionais Padrão (SOPs): Elaborar documentos técnicos, guias e templates para garantir governança, auditoria e reprodutibilidade dos processos.
• Documentação robusta: Criar e manter documentação completa e clara, garantindo que pipelines e procedimentos possam ser mantidos, auditados e evoluídos pela equipe no futuro.

Requisitos

• QUALIFICAÇÕES MÍNIMAS
  • Mestrado em Bioinformática ou áreas correlatas envolvendo ciências da saúde, biologia computacional, genética, ciência de dados biomédicos ou informática aplicada à genômica humana.
  • Mínimo de 3 anos em bioinformática (acadêmica ou profissional), com atuação comprovada em genômica.
  • Experiência sólida no desenho, implementação, operação e otimização de pipelines reprodutíveis (pré-processamento, mapeamento, chamadas de variantes, joint-genotyping etc.).
  • Participação prévia como bioinformata em projetos de genômica.
  • Experiência prática com Nextflow e/ou WDL/Cromwell, incluindo execução em ambientes HPC.
  • Domínio de ferramentas essenciais: GATK, BWA, samtools/bcftools, Picard.
  • Uso de ontologias biomédicas (HPO, SNOMED, OMOP) ou experiência em mapeamento de metadados clínicos.
  • Experiência com containers (Docker, Singularity/Apptainer).
  • Vivência em QC e curadoria de dados genômicos.
  • Conhecimento de ambientes HPC (SLURM, filas, quotas, logs, storage distribuído).
  • Sólida experiência em Linux e Shell Script.
  • Experiência com Git, versionamento, CI/CD e boas práticas de engenharia de software.
  • Abordagem analítica e orientada à solução de problemas.
  • Capacidade de trabalhar em ambiente colaborativo e de alta responsabilidade científica.
• QUALIFICAÇÕES PREFERENCIAIS
  • Experiência com padrões GA4GH (htsget, refget, DUO, Phenopackets).
  • Experiência no uso de ferramentas e estrutura de dados para registro de dados fenotípicos como RedCAP.
  • Familiaridade com modelos de dados clínicos, especialmente OMOP-CDM.
  • Inglês intermediário.
  • Doutorado em Bioinformática ou áreas correlatas.
  • Publicações científicas relevantes em genômica ou bioinformática.
  • Experiência prévia em projetos nacionais ou multicêntricos de grande escala.
  • Experiência com pipelines nf-core, HAIL ou Spark genômico.
  • Conhecimento de processamento em GPU e Nvidia Parabricks em genômica.

• Apoio no desenho e implementação de pipelines de bioinformática: Colaborar no desenvolvimento e na execução de pipelines reprodutíveis (pré-processamento, alinhamento, chamadas de variantes), utilizando containers e aprendendo melhores práticas internacionais (GATK Best Practices, nf-core), sempre com supervisão da equipe mais experiente.
• Suporte na definição de métricas e painéis de QC: Apoiar a equipe na verificação da qualidade de sequências (FASTQ/BAM/VCF) e metadados clínico-fenotípicos, auxiliando no cálculo de métricas, organização de relatórios e identificação inicial de possíveis inconsistências.
• Auxílio em rotinas de automação: Contribuir para a criação e manutenção de rotinas automatizadas para ingestão e validação de dados, seguindo modelos, scripts e frameworks já utilizados pela equipe, com foco em padronização e eficiência.
• Apoio à consolidação de catálogos e metadados: Participar da organização e atualização de catálogos de variantes e metadados, ajudando em tarefas de indexação, versionamento e harmonização de informações conforme ontologias e padrões reconhecidos.
• Colaboração na elaboração de Procedimentos Operacionais Padrão (SOPs): Ajudar na preparação de documentos técnicos, guias e templates, contribuindo para a padronização e reprodutibilidade dos processos, com orientação da equipe técnica.
• Participação na documentação dos processos e pipelines: Auxiliar na criação e manutenção da documentação das soluções implementadas, garantindo clareza, organização e apoio ao trabalho da equipe, contribuindo para a rastreabilidade e evolução futura dos processos.

Requisitos

• QUALIFICAÇÕES MÍNIMAS
  • Graduação completa em Bioinformática, Biologia, Biotecnologia, Computação, Engenharia Biomédica ou áreas correlatas OU especialização/mestrado em áreas relacionadas à genômica, biologia computacional ou análise de dados biomédicos.
  • Experiência prévia de pelo menos 1 ano em bioinformática (projetos acadêmicos, iniciação científica, estágios, ICs, TCCs, participações em laboratórios ou grupos de pesquisa).
  • Experiência básica com pipelines ou etapas bioinformáticas (pré-processamento, alinhamento, chamadas de variantes).
  • Participação em projetos ou atividades envolvendo dados genômicos, exoma ou painéis — acadêmicos ou profissionais.
  • Conhecimento inicial de Nextflow e/ou WDL/Cromwell, com disposição para aprofundamento e aprendizado prático.
  • Familiaridade com ferramentas essenciais: BWA, samtools/bcftools, Picard, FastQC, mesmo que aplicada em contextos acadêmicos.
  • Interesse e noções básicas sobre ontologias biomédicas (HPO, SNOMED, OMOP) ou metadados clínicos.
  • Experiência inicial com containers (Docker ou Singularity/Apptainer).
  • Noções de QC e curadoria de dados genômicos (ex.: uso de FastQC, MultiQC).
  • Conhecimento básico de ambientes Linux e Shell Script.
  • Familiaridade com Git e versionamento de código.
  • Interesse em aprender sobre execução em HPC (SLURM, filas, quotas).
  • Boa capacidade de organização e aprendizado contínuo.
  • Abordagem analítica e curiosidade científica.
  • Facilidade para trabalhar em equipe multidisciplinar.
  • Comunicação clara e abertura para receber orientação técnica.
• QUALIFICAÇÕES PREFERENCIAIS
  • Conhecimento introdutório sobre padrões GA4GH (ex.: já ter lido ou utilizado Phenopackets, DUO, htsget).
  • Experiência prévia com ferramentas de coleta e organização de dados clínicos/fenotípicos (ex.: REDCap).
  • Inglês básico ou intermediário para leitura de documentação técnica.
  • Publicações acadêmicas, posters ou apresentações em eventos científicos.
  • Participação em competições, hackathons ou cursos avançados de bioinformática.

• Supervisionar a rotina do setor de laudos, garantindo qualidade, prazos (SLA) e padronização técnica dos relatórios genéticos.
• Coordenar equipe de especialistas, responsáveis por interpretação de variantes, revisão técnica e emissão de laudos.
• Apoiar a equipe científica em casos complexos, discussões clínicas e revisões de literatura.
• Validar e aprovar versões finais dos laudos, assegurando conformidade com requisitos regulatórios (RDC 302/2005, ISO 15189) e políticas internas de qualidade.
• Controlar indicadores de desempenho (TAT, número de laudos emitidos, retrabalhos, acurácia, SLA de resposta a dúvidas técnicas).
• Garantir a integração com os setores de bioinformática, atendimento clínico e qualidade para solução de não conformidades e dúvidas de clientes.
• Participar da padronização de templates e textos técnicos (diagnósticos de longevidade, painéis genéticos, exomas e exames funcionais).
• Contribuir com treinamento e capacitação contínua da equipe em interpretação genômica, correlação clínica e ferramentas de apoio à decisão.
• Apoiar o desenvolvimento de novos produtos e revisões técnicas do portfólio de medicina de precisão.

Requisitos

• QUALIFICAÇÕES MÍNIMAS
  • Formação superior em Biomedicina, Biologia ou áreas correlatas, com habilitação em Biologia Molecular.
  • Experiência comprovada em emissão, revisão ou supervisão de laudos de genética molecular (painéis NGS, exoma, ou equivalentes).
  • Conhecimento sólido em interpretação de variantes (ACMG/ClinVar), bases genômicas públicas, e correlação genótipo-fenótipo.
  • Experiência com ferramentas e pipelines de análise bioinformática (ex: Sophia, Illumina, MGI, VarSome, etc.).
  • Habilidade em gestão de equipe, priorização de demandas e comunicação interdepartamental.
  • Inglês técnico (leitura de artigos e guidelines).
  • Experiência com técnicas de Biologia Molecular e Genômica.
  • Inglês – Nível Intermediário.
• QUALIFICAÇÕES PREFERENCIAIS
  • Pós-graduação ou mestrado/doutorado em genética, genômica ou áreas correlatas.
  • Experiência em exames de longevidade, farmacogenômica ou medicina personalizada.
  • Vivência com ISO 15189, auditorias internas, e gestão de indicadores laboratoriais.
  • Profissional com visão estratégica, atenção a detalhes e alto senso de responsabilidade técnica, capaz de equilibrar qualidade científica, prazos e experiência do cliente, contribuindo para a evolução dos processos e da equipe.

Benefícios

• Assistência médica.
• Vale-refeição.
• Vale-transporte.

• Realização e análise de exames por meio de técnicas de Biologia Molecular.
• Garantir a qualidade técnica e o cumprimento dos prazos dos exames.
• Flexibilidade para atuar em diferentes rotinas do laboratório.
• Trabalho em equipe, mantendo o bom relacionamento do grupo.
• Buscar sempre a atualização frente às mudanças tecnológicas da área de Genômica.

Requisitos

• QUALIFICAÇÕES MÍNIMAS
  • Superior completo em Biomedicina, Biologia ou áreas afins.
  • Conhecimento e experiência em técnicas de Biologia Molecular.
  • Conhecimento teórico e prático em técnicas de extração de DNA.
  • Conhecimento teórico e prático em técnicas de PCR e Sequenciamento por Sanger.
  • Conhecimento teórico e prático em MLPA.
  • Conhecimento teórico e prático em Sequenciamento de Nova Geração (NGS).
  • Necessário Registro no respectivo conselho ATIVO.
• QUALIFICAÇÕES PREFERENCIAIS
  • Pós-graduação na área (concluída/andamento).
  • Inglês para leitura/escrita.

Benefícios

• Benefícios Flexíveis – Cartão Flash.
• Plano de Saúde Bradesco.
• Seguro de Vida.
• Plano Odontológico (Opcional): SulAmérica.
• Auxílio Creche.
• Gympass e TotalPass.
• Clude Saúde.