Analista de controle de qualidade sr (bioinformática) – São Paulo/SP

Efetivo (CLT)

Responsabilidades

Desenvolvimento, validação e execução de pipelines bioinformáticos integrados (Snakemake, Docker, Python) para detecção de agentes virais adventícios.
Análise e processamento bioinformático de dados brutos de NGS (FASTQ) oriundos de sequenciamento por síntese (Illumina NextSeq 1000).
Execução de etapas de alinhamento, atribuição taxonômica (Kraken2, BLAST) e filtragem de sequências da espécie hospedeira (host_taxid).
Análise crítica dos parâmetros de controle de qualidade (QC) da corrida e das amostras: produção de bases (Gb), índice Q30, taxa de duplicatas, eficiência de cobertura e cobertura de genomas virais alvos.
Investigação de falsos positivos, background ambiental, homologia com o genoma do hospedeiro (retrovírus endógenos) e avaliação do perfil de controles (NTC e PC).
Elaboração de documentações técnicas: POPs, métodos, protocolos e relatórios analíticos.
Interface técnica com a equipe de bancada, responsável pelas etapas de sequenciamento, para troubleshooting em etapas de extração de ácidos nucleicos, construção automatizada de bibliotecas (estação Bravo) e captura de alvos (painel Twist).
Cumprimento das normas de BPL (Boas Práticas de Laboratório), Segurança do Trabalho, Biossegurança, Ética e diretrizes do sistema de qualidade para gestão de contaminação.

Superior Completo em: Química, Farmácia, Engenharia Química, Biologia, Medicina Veterinária, Biotecnologia, Biomedicina, Ciências Moleculares, Gestão de Controle de Qualidade.
Experiência avançada em análise bioinformática de dados de NGS aplicados à metagenômica ou detecção de vírus.
Experiência na construção e manutenção de pipelines automatizados (Snakemake, Python, Bash) e uso de ambientes conteinerizados (Docker).
Experiência prática com algoritmos de taxonomia e alinhamento local/global (Kraken2, BLAST).
Imprescindível inglês avançado (leitura, escrita e fala). Precisa ser capaz de participar de treinamentos e reuniões em inglês.